Naujos kartos (Next Gen) sekoskaita

Siūlome šias NGS paslaugas:

 - de novo sekoskaitą: paslauga rekomenduojama, kai reikia nustatyti dar nesekvenuoto organizmo DNR seką. Galime pasiūlyti pilną paslaugos projektą "mėginio DNR - gautų duomenų analizė ir ataskaita". Kiekvieno projekto atveju mūsų auščiausios klasės specialistai aptars jūsų poreikius ir lūkesčius individualiai.

        Daugeliui de novo projektų siūlome hibridinę strategiją, mėginio sekoskaitą atlikti 2-iem skirtingomis plaformomis: 3-ios kartos sekvenatoriumi PacBio RS II, kur nustatomi ilgų DNR fragmentų (iki 30 kbp) seka, sudaromi genomo "griaučiai" ir Illumina HiSEQ2500 sistema, kurios pagalba gaunamas didelis kiekis duomenų pakartojimų. Šie pakartojimai ištaiso galimas klaidas, padidina rezultatų patikimumą.

- persekvenavimo sekoskaitą: paslauga rekomenduojama, kai reikia patikslinti ar nustatyti vieno nukleotido polimorfizmą (SNPs), chromosomų persitvarkymus, jų trūkio taškus ar nustatyti retus genetinius variantus.

- transkripų sekoskaitą (RNA-SEQ). mRNA-Seq paslaugos pagalba galite nustatyti visus organizmo transkripus be papildomų zondų ar pradmenų.

- mažųjų RNA sekoskaitą: ši paslauga leidžia aptikti visas net pačias rečiausias mažąsias RNR bet kuriame organizme, aptikti bei apibūdinti mutacijas, analizuoti tam tikrą kryptingą visų mažųjų RNR ekspresiją mėginyje.

- metagenominę sekoskaita: labai populiari paslauga, leidžianti analizuoti pasirinktą mėginį ir nustatyti visas organizmų rūšis, esančias tame mėginyje. Mėginio DNR yra paprastai analizuojama ant Illumina MiSeq platformos (gaunami 300bp fragementų DNR nuskaitymai). Galima prieš analizę kryptingai padauginti tam tikrus regionus: bakterijos 16S ar grybų  ITS genų fragmentus ir t.t. Kiekvienu atveju sekoskaitos strategija  yra pirmiausiai aptariama su užsakovu.

- ChiP-SEQ sekoskaitą: ši sekoskaita padeda nustatyti genomo histonų modifikacijas, baltymų-DNR sąveikas, nustatyti pagrindinių (konsensusinių) baltymų prisijungimo prie DNR vietas.

Mūsų partneris teikiant NGS sekoskaitą yra BaseClear:   http://www.baseclear.com/

 Patirtis: esame jau atlikę daugybę de novo, mi-RNA, metagenominių ir Chip-SEQ projektų. Daugiau informacijos ir kainų teiraukites: info@nanodiagnostika.lt

 

 

 

 -

 
smart foreash